A varsázást, mint halászati tevékenységet a törvény szerint csak a halgazdálkodási hasznosító (RDHSZ) végezheti. A törpeharcsa-varsa hatékony eszköz a törpék ellen, és a szövetség tervezi is a használatát a legfertőzöttebb helyeken – leginkább a mellékvizeken –, azonban ez körülményes és drága tevékenység. Viszont akár pályázati pénzek is elérhetőek lehetnek e célra. Még egy eredményes módszer van a gyérítésre: a felhőbe összeálló kis törpeharcsák begyűjtése, amelyben a horgászok is tudnak segíteni.
Probléma az is, hogy mi legyen a kifogott halakkal? Eladni nem egyszerű - bár nem lehetetlen -, a szerves hulladékként való elszállítás pedig további komoly költséget jelent.
Amikor túlzottan elszaporodnak a törpék, akkor a természet maga is elvégzi a dolgát: ekkor szokott felbukkanni egy olyan herpesz vírus, ami csak a törpeharcsát támadja meg. Emiatt szoktak hirtelen eltűnni a törpék egy-egy környékről.